The seminar  will summarize the fundamentals and applications of the  crystallographic and not crystallographic methods of structural characterization.  In details, investigation methods  devoted to small molecules  and materials and to macromolecules of biologica interest will be described.

Questo corso esplora i meccanismi epigenetici e l’architettura della cromatina come pilastri fondamentali della regolazione dell’identità cellulare, analizzando come uno stesso genoma possa dare origine a fenotipi diversi in contesti fisiologici e patologici. Attraverso l’esame di processi chiave, quali la metilazione del DNA e le modifiche istoniche, verrà approfondito il modo in cui la cellula “scrive”, “legge” e “cancella” le informazioni regolatorie necessarie al mantenimento della propria memoria funzionale.
Verranno inoltre esaminate alcune delle più avanzate tecnologie di Next-Generation Sequencing — tra cui ChIP-seq, CUT&RUN, ATAC-seq e Hi-C — che consentono di mappare l’accessibilità della cromatina e l’organizzazione tridimensionale del genoma con elevata risoluzione. Infine, analizzeremo come la riprogrammazione degli enhancer e dei super-enhancer possa guidare la progressione tumorale e la plasticità metastatica, discutendone le implicazioni per la medicina di precisione e per l’editing dell’epigenoma tramite sistemi CRISPR.
Nella seconda parte del corso verranno trattati i principi e le principali metodologie bioinformatiche per l’analisi dei dati NGS, illustrando il workflow che conduce dall’allineamento delle sequenze al genoma di riferimento fino all’identificazione delle regioni arricchite (“peaks”) e alla loro visualizzazione mediante genome browsers. Il livello di approfondimento tecnico di questa sezione sarà calibrato in base alle conoscenze di base dei partecipanti.